甲型流感病毒(IAV)核酸检测试剂盒(荧光 PCR 法)
商品名称:甲型流感病毒(IAV)核酸检测试剂盒(荧光 PCR 法)
Name :Avian Influenza Virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包装规格】50T/盒
【预期用途】
甲型流感是由甲型流感病毒(AIV)引起的一种禽类传染病,鸡、火鸡、鸭和鹌鹑等家禽均可感染,发病情况差别较大,有的出现急性死亡,有的无症状带毒。水禽是 AIV 的自然宿主,也是流感病毒的天然基因库,几乎所有亚型的流感病毒都可以在水禽中分离到[1]。在世界范围内,家禽中流行的主要有 H5、H6、H7、H9 等亚型。H5 和 H7 亚型的某些毒株可以造成禽类很高的发病率和死亡率,被称为高致病性甲型流感(HPAI)病毒。OIE 将高致病性甲型流感列为 A 类动物疫病,我国也将其列为一类动物疫病[2-3]。
本试剂盒利用实时荧光 PCR 原理,检测甲型流感病毒,对甲型流感诊断有重要指导意义。
【检验原理】
本试剂盒针对甲型流感病毒 M 基因高度保守区域设计特异性引物和探针,在反应体系中含甲型流感病毒基因组模板的情况下,PCR 反应得以进行并释放荧光信号。利用仪器对 PCR 过程中相应通道的信号强度进行实时监测和输出,实现检测结果的定性、定量分析。
【试剂组成】
包装规格
50T/盒
IAV 反应液
500μL×2 管
酶液
50μL×1 管
IAV 阳性质控品
50μL ×1 管
阴性质控品
250μL ×1 管
注:1)不同批号试剂不能混用。
2)试剂盒内各试剂组份足够包装规格所标示的检测次数。
【储存条件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、运输、反复冻融次数不超过 5 次,有效期 12 个月。
【适用仪器】
ABI7500、安捷伦 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列荧光定量 PCR 检测仪。
【标本采集】
病死或扑杀动物,取喉气管、脑、胸肌、心肌和肺等组织;待检活动物,用棉拭子取呼吸道分泌物或排泄物,置于 1mL 50%甘油生理盐水中。
【保存和运输】
采集或处理好的样品在 2℃~8℃条件下保存应不超过 24 h;若需长期保存,应放置-70℃以下保存,冻融不超过 3 次
【使用方法】
1.
样品处理(样本处理区)
1.1
样本前处理
每份组织分别从 3 个不同的位置称取样品约 1g,手术剪剪碎混匀后取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理盐水后继续研磨,待匀浆后转至 1.5mL 灭菌离心管中,8000rpm 离心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 灭菌离心管中;棉拭子直接取 100μL 于 1.5mL 灭菌离心管中。
1.2
核酸提取
推荐采用优利科(上海)生命科学有限公司生产的核酸提取试剂(离心柱法)进行核酸提取,请按照试剂说明书 进行操作。
2.
试剂配制(试剂准备区)
根据待检测样本总数,设所需要的 PCR 反应管管数为 N(N=样本数+1 管阴性对照+1 管阳性对照;反应管数每满 10 份,多配制 1 份),每测试反应体系配制如下表:
试剂
IAV 反应液
酶液
用量
19μL
1μL
将混合好的测试反应液分装到 PCR 反应管中,20μL/管。
3.
加样(样本处理区)
将步骤 1 提取的核酸、阳性质控品、阴性质控品各取 5μL,分别加入相应的反应管中,盖好管盖,混匀, 短暂离心。
4.
PCR 扩增(核酸扩增区)
4.1
将待检测反应管置于荧光定量 PCR 仪反应槽内;
4.2
设置好通道、样品信息,反应体系设置为 25μL;荧光通道选择:
检测通道(Reporter Dye)FAM, 淬灭通道(Quencher Dye)NONE,ABI 系列仪器请勿选择 ROX 参比荧光, 选择 None 即可。
4.3
推荐循环参数设置:
步骤
循环数
温度
时间
收集荧光信号
1
1cycle
50℃
10min
否
2
1 cycle
95℃
2min
否
3
45 cycles
95℃
15sec
否
60℃ 30sec 是
5.
结果分析判定
5.1
结果分析条件设定(请参照各仪器使用说明书进行设置,以分析 ABI7500 仪器为例)
反应结束后自动保存结果,根据分析后图像调节 Baseline 的 Start 值、End 值以及 Threshold 值(用户可根据实际情况自行调整,Start 值可设在 3~15、End 值可设在 5~20,使阈值线位于扩增曲线指数期,阴性质控品的扩增曲线平直或低于阈值线),点击 Analyze 自动获得分析结果。
5.2
结果判断
阳性:检测通道 Ct 值≤40,且曲线有明显的指数增长曲线; 阴性:样本检测结果 Ct 值>40 或无 Ct 值。
5.3
质控标准
阴性质控品:无特异性扩增曲线或无 Ct 值显示;
阳性质控品:扩增曲线有明显指数增长期,且 Ct 值≤32; 以上条件应同时满足,否则实验视为无效。
6.
检测方法的局限性
1.
样本检测结果与样本收集、处理、运送以及保存质量有关;
2.
样本提取过程中没有控制好交叉污染,会出现假阳性结果;
3.
阳性对照、扩增产物泄漏,会导致假阳性结果;
4.
病原体在流行过程中基因突变、重组,会导致假阴性结果;
5.
不同的提取方法存在提取效率差异,会导致假阴性结果;
6.
试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定量检测不准确的结果;
7.
本检测结果仅供参考,如须确诊请结合临床症状以及其他检测手段。
【注意事项】
1.
所有操作严格按照说明书进行;
2.
试剂盒内各种组分使用前应自然融化,完全混匀并短暂离心;
3.
反应液应避光保存;
4.
反应中尽量避免气泡存在,管盖需盖紧;
5.
使用一次性吸头、一次性手套和各区专用工作服;
6.
样本处理、试剂配制、加样需在不同区进行,以免交叉污染;
7.
实验完毕后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
8.
试剂盒里所有物品应视为污染物对待,并按照《微生物生物医学实验室生物安全通则》进行处理。
【参考文献】
[1]
Webster R G, Bean W J, Gorman O T, et al. Evolution and ecology of influenza A viruses [J]. Microbiological Reviews, 1992, 56(1): 152-179.
[2]
Shortridge K. Avian influenza A viruses of southern China and Hong Kong: ecological aspects and implications for man [J]. Bulletin of the World Health Organization, 1982, 60(1): 129.
[3] 张烨, 舒跃龙. 2004–2012 年我国甲型流感流行情况 [J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2013, 27(3): 239-240.